家用冰箱保藏菌种是菌种保藏方法中常用、简单也经济的方法，它不仅具有良好的抑制菌种生长的作用，而且具有明显的延缓菌种老化的作用。为了节约资金，降低成本，许多菇农常将菌种直接放在家用冰箱而不是专用冰箱内进行保藏。由于家用冰箱长期放有水果、饮料、肉蛋等食物，病原微生物可能乘虚而入，使用家用冰箱保藏菌种时应特别注意预防菌种感染。
为了避免菌种在保藏过程中受到感染，认识和了解菌种感染的原因十分必要。家用冰箱虽然温度很低，不利于中高温型病菌生长繁殖，但低温型病菌依旧可以正常生长繁殖，而且少数中高温型病菌由于长期在冰箱的冷藏箱4-6摄氏度的状态下生存，已逐渐适应了低温环境，与低温型病菌一道，成为食用菌菌种的感染源。同时，在将水果、饮料、食品等食物放入冰箱的同时，一些病原微生物也随之侵入，如果其中混有托兰斯假单胞杆菌，则易使平菇菌种产生锈斑病，平菇菌种在这样的环境下保藏时间越长，则锈斑病越严重。另外，冰箱的冷藏箱相对湿度较大，病原微生物非常容易生长繁殖，菌种被感染的机率也相应增大。
